訂正注文書を出す事はできますか?

はい、可能です。

訂正に関しては、特に言った言わないの問題が発生しやすいので必要だと考えています。
訂正内容に応じて、「訂正注文書(納期変更)」、「訂正注文書(数量変更)」、「訂正注文書(数量・単価変更)」 などのタイトルで訂正注文書が出力されます。

また、発注の取消の際には取消注文書の出力もできます。